Kulliyyah al-Quran dan Sunnah telah menjalinkan persefahaman pendidikan dengan tiga buah institusi pengajian tinggi iaitu:
1. Institut al-Quran Darul Aman (IQDAR) Kedah Darul Aman.
2. Kolej Islam Teknologi Antarabnagsa (KITAB) Pulau Pinang
3. Institut al-Quran Terengganu (IQT).
Dalam pada itu, Kulliyyah al-Quran dan Sunnah juga dalam rencana menjadikan beberapa buah sekolah sebagai sekolah angkat yang berperanan sebagai feeder Kulliyyah al-Quran dan Sunnah. Antaranya:
1. Institut Pendidikan Islam dan Tahfiz al-Quran (ABADA) Kedah.
2. Maahad Tahfiz Sains Darul Aman (MTSD) Kedah.
3. Yayasan Pendidikan Maahad Tahfiz al-Quran Wal-Qiraat Addin Perak
